蕉城区纪委、监委合署办公，设立15个职能部门：办公室、组织和宣传部、党风政风监督室、信访室、案件监督管理室、第一至第八纪检监察室、案件审理室、纪检监察干部监督室等14个部门。

蕉城区委巡察工作领导小组办公室为区委工作部门，设在区纪委。

区纪委监委下属事业单位2个，分别为：区纪委监委派驻机构协调中心、区纪委监委信息技术中心。

　　区纪委共派驻纪检组22个。